高架式相対2面4線となっている。北回帰線の通る町で高鐵単独駅。台鐵(在来線)嘉義駅とは別駅なのでご注意を。

駅のテーマは「土地と風景の共生」だが、駅舎は台南駅と共通設計となっている。ホーム施設と駅舎の間には道路があり、改札内歩道橋が結んでいる。周囲は田園風景が広がっている。