日本最北＆最東の新幹線駅。駅舎は橋上構造で、海をイメージしたガラス張りが採用されています。積雪対策として、2面4線の新幹線ホーム全体がガラス張りのチューブで囲まれた地平構造となっています。新幹線11〜14番線ホームの内、中央の12,13番線には転落防止柵が設置されています。恐らく将来の延伸時に備えたものでしょう。また出口までのエスカレータ部は、海猫の翼をイメージしています。隣接する駅ビルには、海水循環水槽の付いた生鮮活魚店が設置されています。